日本是地貌特征奇特的群岛国家。多山地、多地震、多温泉、多火山、多森林、多河流、多湖泊，但平原狭小，资源贫乏。位于亚洲大陆东部，东临太平洋，北濒鄂霍茨克海，西隔日本海、朝鲜海峡、黄海、东海与俄罗斯、朝鲜、韩国、中国相望。日本列岛由本州、北海道、四国、九州四个大岛和3900多个小岛组成，四大岛合计面积约占全国总面积的96%。日本地域狭长，四面临海，全国海岸线总长度约达3.4万公里，东部濒临太平洋一侧有许多天然港湾，很利于建设大型港口。日本是个多山之国，山地面积约占全国总面积的75%，其中一般山地和丘陵占65%，火山地和火山麓占10%。北湾山系和南湾山系纵横贯穿四个大岛，相汇于本州中部。主要山脉有奥羽山脉、木曾山脉、赤石山脉、越后山脉、飞弹山脉、日高山脉、四国山地、九州山地等。富士山为全国第一高峰，世界著名火山，被日本人誉为“圣岳”，是日本民族的象征。该山海拔3776米，山体呈圆锥体形，山顶终年积雪，四周有富士八峰。
多火山、多地震。全国有大小火山200多座，约有45座活火山。由于火山众多而形成大小2万余处温泉。地震十分频繁，每年地震平均多达1500次以上，日平均地震发生率在4次以上。1923年9月1日，日本关东平原南部相模海湾海底发生8.3级海洋型大地震，14.3万人丧生。在1900年以来世界8次大地震中死亡人数居第三位。
平原较少，只占全国总面积的25%，耕地面积仅占12.9%，关东平原最大新潟平原土质最肥沃，后者被誉为“日本的粮仓”。
河流密布，达上百条，主要有利根川、信浓川、石狩川、北上川、天盐川、木曾川六大水系。信浓川最长，为367公里，利根川流域面积最广，达16840平方公里，为日本第一大河。湖泊600多个，最大的琵琶湖，面积为672平方公里；最深的田泽湖，最深处达423.4米。
气候属于温带海洋性季风气候，主要特征多雨、多雪、多台风。年均降水量在1700~1800毫米左右。
资源极端贫乏，现代大工业生产所需主要原料、燃料，绝大部分依赖进口。原材料和能源的对外依赖度为84%，是世界上第一资源、能源进口大国。
森林面积约占全国总面积的64%，居世界第四位。以针叶林为主。
渔业和水产养殖业十分发达。近海渔场是世界著名大渔场，鱼的种类多达700余种，其中主要为沙丁鱼、鳝鱼、青花鱼、霸鱼、马哈鱼等。
